对于缺乏 kit 突变的GIST的发生，近年来日益受到研究者的关注。由于发现即使是在包含野生型 kit 的GIST中KIT 也活化，就把人们的目光引向KIT 相关的受体酪氨酸激酶（RTK）。这一类RTK包括前原癌基因FMS，其编码巨噬细胞集落刺激因子 (M-CSF1) 的受体；两个PDGFR基因：包括PDGFRA和PDGFRB；FLT1与FMS相关的一个前原癌基因。其中PDGFRA 基因和 kit 基因位于人4号染色体的相邻位置上，两者的氨基酸序列有很高的同源性。近来国外报道在28%～67% 无kit突变的GIST中检出了 PDGFRA 的突变，并且 PDGFRA 突变与 kit 突变是相互独立的。因此目前认为获得功能性的 PDGFRA 突变很可能是 GIST 的另一个病因。一方面PDGFRA的信号转导通路与kit 相似，功能性的 PDGFRA 突变可以转化小肠的 Cajal 细胞；另一方面PDGFRA的功能性突变在293T 细胞中能与野生型的 kit 结合并使之活化。这一发现进一步证实了III型RTK的激活在促进GIST发生中的核心作用。国内尚无有关PDGFRA突变的报道。我们在60例中的3例检出了PDGFRA突变（5％），占无KIT表达病例的50％，全部为 18号外显子（活化环结构域）的点突变D842V，为最常见的突变形式。未检测到12号外显子（近膜结构域）的突变。与Medeiros等人的报道相似，此类突变多见于发生在网膜/肠系膜的恶性病例。而最近Lasota J的较大量病例研究表明PDGFRA突变主要发生在胃部，且大多生物学行为呈“良性”经过[6]。因此我国PDGFRA突变的突变情况还需扩大病例数进行研究。

目前证实PDGFRA 18号外显子突变对抑制剂疗效不明显，但仍有30％PDGFRA 突变的病例对伊马替尼敏感的报道提示我们应重视KIT阴性GIST的诊断问题以及应进行相应基因突变检测判断能否适用于伊马替尼治疗。

由此是否可能将GIST按照分子水平上的改变分成至少三种类型，即kit 突变型、PDGFRA突变型和无突变型。因此GIST可以看作是在大多数情况下由单独的分子机制所驱动的肿瘤。而绝大多数人类的癌发病机制复杂，如能按照具有明确的分子改变分类，就有可能针对每一类型实施以特定分子为基础的治疗。由于绝大多数GIST有KIT的高表达，即使是在不具有基因突变的病例中，因此这部分GIST的发生源于何种启动因素，目前尚无相关研究。Kit突变是GIST发生的早期事件，且具有突变的“良性”GIST 大多数并不进展为“恶性”，这表明kit突变本身并不能引起GIST的恶性转化。而导致GIST恶性转化的因素目前还未知。