全面实现８６３计划的战略目标，突破8-10项与国计民生密切相关的有产业化前景的重大基础技术，为解决制约国民经济发展的紧迫问题和实现国家的第二步战略目标做出贡献；所选领域的主要关键技术要达到或接近世界先进水平，带动相关领域的技术发展，提高我国高技术研究发展的总体水平和实力；培养一支跨世纪的高技术队伍和一批出类拔萃的青年专家，充分发挥高技术研究开发基地的作用，为下世纪我国高技术的持续快速发展和高技术产业化建立打下坚实基础。
－－在生物、信息、自动化、能源、新材料领域的一些方面进入国际先进行列，并力争在某些方面保持或达到国际领先的地位，带动相关领域、相关行业的技术发展，提高我国的科技实力，增强综合国力。
－－要为农业的高产、生物医药产业的崛起、民族信息产业的振兴、新材料产业的发展、先进制造业的兴起、未来能源产业的建立和国家安全提供技术支持。加速实验室成果向工业界的辐射，通过与其它计划的衔接和与部门、地方、企业的结合，扶植和发展一批新型高技术产业，改造一批传统产业，获得较高的经济效益和社会效益。为解决国家的热点、难点问题做出显著的贡献。
－－在我国建成一批高技术研究和开发基地，为我国高技术的研究开发和持续发展创造良好的环境和基础条件。
－－培养跨世纪的高技术人才，特别是具有战略思想和交叉综合能力的复合型帅才，造就和保持一支1万人左右的高技术研究开发队伍，稳定一批具有很高学术造诣、站在国际高技术研究前沿的科学家；培育一批有雄厚技术基础、创新能力强的工程技术专家；培养一批懂经营、善管理的高技术企业家和一批现代科技管理专家。
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